Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ASCL3Q9NQ33 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ASCL3Q9NQ33 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms