Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4BQ9NPR2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms