Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IL1RAPQ9NPH3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms