Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CWC22Q9HCG8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CWC22Q9HCG8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms