Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3GQ9HC16 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC3GQ9HC16 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms