Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP29Q9HBJ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP29Q9HBJ7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms