Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A6AQ9H2W1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms