Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL3Q9H2J4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms