Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR1EQ9GZS1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR1EQ9GZS1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms