Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNPKQ9C0E8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNPKQ9C0E8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms