Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKX6-2Q9C056 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms