Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms