Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMCHL2Q9BQD1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms