Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms