Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMG1Q96Q15 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms