Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms