Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms