Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C9orf85Q96MD7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms