Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms