Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZA3Q96KX2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPZA3Q96KX2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms