Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEURL4Q96JN8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms