Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS50Q96JG6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms