Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNFT2Q96EX2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms