Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
COPS9Q8WXC6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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