Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms