Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFRP1Q8N474 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP1Q8N474 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms