Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms