Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGNBQ7Z5D8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NANOGNBQ7Z5D8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms