Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU65

UBN2, Ubinuclein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN2Q6ZU65 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBN2Q6ZU65 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBN2Q6ZU65 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms