Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRSAM1Q6UWE0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms