Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LLGL2Q6P1M3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms