Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L3Q68CJ9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms