Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms