Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN2Q52LD8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms