Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms