Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL38Q2WGJ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL38Q2WGJ6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms