Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC27Q2M243 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC27Q2M243 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms