Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q1T7F1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Q1T7F1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Q1T7F1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q1T7F1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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