Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC142Q17RM4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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