Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms