Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CLPPQ16740 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPPQ16740 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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