Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDK4Q16654 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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