Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCAQ16586 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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