Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP7Q16576 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms