Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SF3A1Q15459 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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