Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMD6Q15008 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms