Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIXQ14938 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIXQ14938 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms