Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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