Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1SQ13698 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1SQ13698 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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