Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUL4AQ13619 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CUL4AQ13619 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms